早在1925年，国际社会正在日内瓦协商签订“禁止在战争中使用细菌武器的协议”，日本就“怀有私心”拒绝参加这个协议的缔结。后来日军所以要发展细菌武器，是因为他们认为细菌武器是一种很有利的进攻性武器，若不进行此种准备，在实现自己的目标过程中，会遇到严重的困难。石井四郎就曾说过：“日本没有充分的五金矿藏及其他制造武器所必需的原料，所以日本务必寻求新式武器，而细菌武器便是其中之一。”（注：731部队生产部部长军医少将川岛清受审记录，见《前日本陆军军人因准备和使用细菌武器被控案审判材料》，莫斯科外国文书籍出版局，1950年）明确地表述了日本军部的考虑。说明日军早有罪恶打算。明知细菌武器与人道和科学不相容，但从1928年起派石井四郎远赴欧洲考察学习细菌作战（当时还未发生诸如9？18事变等侵华战争和第二次世界大战），就在考虑、策划和准备使用细菌武器，作为其对外战争政策一部分了。
自1930年始，到1945年止，在日本天皇和军部的策划和命令下，侵华日军历时15年之久，在中国构建了一个规模庞大，组织机构齐全的细菌部队。这支部队隶属于参谋本部第九陆军技术研究所（九研，也叫“登户研究所”）领导，同时也隶属于各地区派遣军。中国全面抗战爆发后。由于战线不断拉长，侵华日军的细菌战部队也随之大规模扩充。细菌战部队兵力总计达20000多人，其中科学研究人员就达7000至8000名。侵华日军细菌战部队大体分五个部分，分别驻在当时中国的哈尔滨、长春、北平、南京、广州分属于各地区派遣军。1938年7月，成立了18个师团属防疫给水部队（即细菌战部队），在战场上的各个师团中进行活动，并在华北、华中、华南数十个城市设立了支队，来从事细菌战活动。整个中华大地基本上都笼罩在日军的细菌战网络中。
太平洋战争以前，侵华日军主要分四个作战区域，关东军专司中国东北谋略；其它侵华军队按日军大本营1939年发布大陆令362号，组建专司侵略中国内地的中国派遣军。中国派遣军按照战区又划分为北支派遣军、南支派遣军、中支派遣军等。北支派遣军（原称华北驻屯军），驻中国华北平、津、冀、察一线；中支派遣军（又称华中方面军），驻上海——南京——武汉一线；南支派遣军，驻广州——香港一线。
侵华日军四支细菌战部队分别是：
一、归关东军节制的细菌部队
（1）关东军第731部队，全称满洲第731部队（对外称防疫给水部队）。
731部队总部设在中国东北哈尔滨市郊的平房区，对外伪装成一个水净化部队。部队长石井四郎。731部队是在抗日战争（1937-1945）和第二次世界大战期间，侵华日军从事生物战细菌战研究和人体试验相关研究的秘密军事医疗部队。731部队的前身，是石井四郎于1932年在中国东北哈尔滨市郊背阴河设立的东乡部队，该部队最早开始进行的是在日本国内无法进行的人体实验。1932年，石井四郎率部队修建中马城——哈尔滨市郊的监狱。1935年的一次监狱暴－动迫使石井关闭中马城。石井到离哈尔滨更近的平房区重新设立一个新的设施673部队在黑河孙吴县建立细菌实验基地，包括动物饲养、制菌室等300间建筑。731部队原来定员2000人，1939年10月石井四郎把731部队工作人员后扩充到3000人。
