而妙玉进了寺院后更是大胆的要求寺院的老住持亲自为她做剃度仪式，可奇怪的是老住持并没有生气，更没有反对，而是欣然的点了点头，在大雄宝殿里亲自为她做了剃度，老住持很喜欢这个小姑娘，给她起了妙玉这个法名，将她安排在寺院附属的一个庵堂里。
寺院里的和尚尼姑认为妙玉是萧府送来的，所以老住持才不敢拒绝妙玉的要求，只是一种强作欢喜的行为，但老住持明白，只有想成为什么才会变成什么，他仿佛已经看到了十年后新住持的身影，身在寺院的妙玉还不时的与上京萧府保持着书信往来，可这只保持了两年，书信的往来就突然中断了，因为妙玉竟然闭关了。
而来到寺院仅有两年且只有十岁的妙玉要求闭关却得到了老住持的首肯，老住持派人将关房、护侣等相关条件准备好，选了一个良辰吉日将妙玉送进了关房，而寺院的和尚尼姑在等着好戏看，以为这只是一个十岁女童的瞎胡闹，但令他们没有想到的是，进入关房的妙玉第三天就从里面将关房反锁上了，而当关房的门从里面再次打开的时候，已经过去了三年。
第一次出关后的妙玉没多长时间就又再次进入关房，又开始了第二次为期三年的闭关生活。
等她第二次出关的时候，几经是一位十六岁亭亭玉立的少女，当她打开关房的房门，走出来的时候，长长的头发已经过腰，而她的眼前聚集着如朝圣般的人群，因为在她闭关其间，寺院周边有看不起病的贫民，听说寻空寺里有一位再次闭关的女童子，就试着来到妙玉闭关的关房门前不远处，向关房跪拜，祈求身体早日康复，而神奇的是，他们的身体不久就真的康复了，他们认为妙玉是菩萨转世，于是一传十，十传百，来寺院祈求疾病康复的人是越来越多，后来竟发展成祈求什么的都有，但都没有祈求健康的灵验。
但即使这样，寺院的香火钱也增加了许多，和尚尼姑们开始对妙玉的闭关行为表示钦佩，对老住持当初的决定更是认为老住持的修持很深，确实比他们看的深远和透彻。
妙玉提前一个月就把自己将要出关的日期告诉了护侣，所以人们这才聚集在关房门口等待妙玉的出关，妙玉面对朝拜的人群，只说了几句话，说自己不是什么菩萨转世，是信众的心诚则灵救了自己，说疾病缠身最容易让人们感受到自身的渺小和脆弱，只有向内心的最深处寻找，人们才会获得最终的解脱。
说完在护侣的护送下离开了人群，来到了方丈之地。妙玉向老住持跪拜行礼，老住持连忙扶起说道：“恭喜你又上了一个台阶，但此去雷音尚远，不如歇一歇，再往前走，不知你意下如何。”
妙玉躬身礼拜道：“徒儿遵命。”
老住持满意的点了点头说道：“去吧，你的新禅房已经准备好了，我也有些累了，也许用不了两年，就要传衣钵给下一任住持了。”
